澳門利氏學社的使命致力於展現澳門作為通往中國的特殊門戶的角色。澳門多年來一直是傳教士的交匯點，也是中西文化交流的中心。學社的初啟靈感源自於利瑪竇（1552-1610）的生平，他是一位真正的中國之友，致力於將儒家、佛教、道家、伊斯蘭教以及基督教信仰融入現代社會。

澳門利氏學社成立於1999年12月10日，即澳門回歸中國前幾天（12月20日）。2000年7月26日，學社正式成為澳門的公共機構。然而，學社的起源可以追溯到1994年，當時澳門市政府慶祝了耶穌會於1594年創辦聖保祿大學的400週年。

耶穌會與澳門在許多方面有著共同的起源和450年的歷史淵源。澳門的耶穌會士始終致力於服務人類，無論是在教育或物質援助方面，都竭力幫助人們，但更重要的是，他們始終關注文化的根基所在——人們的理想與希望。這項耶穌會傳統在今日的澳門利氏學社得以延續。因此，學社致力於搭建中西之間的橋樑。澳門在促進不同文化與中國之間的對話方面有著獨特的歷史。

這所獨立的非營利研究機構隸屬於澳門耶穌會，並在教學和研究領域與澳門聖若瑟大學開展了多項合作項目，並共同舉辦了多場促進這些領域發展的會議。

澳門利氏學社提供文化、專業和研究相結合的獨特課程，其宗旨和方法體現在其與澳門這座城市、利瑪竇、耶穌會以及中國人民的緊密聯繫之中。