清安醫所為進教圍內的一個教友組織，成立於清光緒年代。現時的地址是在1895年因進教圍坊重新規劃，把之前原設於北閘的醫所轉到現址。太平洋戰爭起，醫所一度請耶穌寶血修女會派修女來主持，直到上世紀80年代。

2021年，清安醫所值理會鑒於醫所日久失修，陳舊又老化，決定把院舍加以優化並進行修葺工程。現時清安醫所可容納院友45人。