1月9日 — 耶穌會會士潘日明神父,在葡國米蘭德拉醫院逝世,息勞歸主,享年八十二歲。
1月10日 — 澳門明愛九八年聖誕慈善餐會,籌得善款逾澳門幣九十萬元。
1月24日 — 澳門天主教二千禧年活動籌委會為迎接千禧聖年展開多項活動,全年活動主題為「與基督同行・邁向新紀元」。首項活動與基督徒合一祈禱聚會。
1月31日 — 澳門前利瑪竇中學副校長、耶穌會會士明勵志神父,安息主懷,享年八十八。
1月31日 — 鮑思高青年服務網絡,慶祝青年中心成立,由林主教主持中心新址祝聖儀式,並由多位嘉賓主持揭幕剪綵禮。
2月1日 — 鍾志堅神父獲委任為教區青年牧民中心主任。
2月25日 — 澳門高等校際學皖,隆重舉行新校舍啓用典禮,敦請里斯本宗主教普利加保、葡國前總統蘇亞雷斯博士、澳督韋奇立將軍、教區林家駿主教等主持新校舍揭幕祝聖啓用典禮。里斯本宗主教普利加保及葡國前總統蘇亞雷斯訪澳期間,林主教在主教府設宴熱烈歡迎。
2月26日 — 聖心英文中學舉行每年一度的慈善步行活動,籌得善款共二十萬元。
3月14日 — 天主教二千禧年活動籌委會在3月至6月間,舉辦「認識中國教會系列」講座。
3月19日 — 教區林家駿主教主持澳門文化中心祝聖禮。
3月19日 — 瑪利亞方濟各會慶祝九十四高齡的S. Rosula 修女入會七十年藍寶石慶,及陳芝琴修女入會五十年金慶。
3月21日 — 林主教拜會訪澳的葡國總統沈拜奥。
3月24日 — 林主教委任神職和教友,組成二千禧年世青日工作小組。
3月31日 — 聖安多尼堂頤老之家主辦的第六屆澳門耆老書監展。
4月3日 — 復活前夕,共有七十七位弟兄姊妹領洗皈主(嬰兒除外)。
4月4日 — 化地瑪聖母女子學校組團,往天津、北京進行教學觀摩。
4月14日 — 香港聖公會教省鄭廣傑大主教及除贊生主教偕同牧師聖職人員訪澳,與林主教友好會晤。
4月17日 — 泰澤修士來澳,與教友一起舉行分享及祈禱聚會。
4月17日 — 慈幼會華近禮神父慶祝晉鐸金禧。
4月24日 — 天主教學校聯會舉辦教育研討日,千六教師雲集,研討交流。
4月25日 — 教區慶祝普世聖召節,在感恩祭中,十位金銀慶司鐸修女接受祝賀;此外又舉行大型的聖召節活動。
4月27日 — 北京宗教局應澳門佛教、基督教和天主教的邀請,組團前來澳門訪問。
4月27日 — 瑪利亞方濟各傳教修會陳芝琴修女,在青島醫院病逝,安息主懷,享年七十六歲。
5月1日 — 祐漢區聖若瑟勞工主保堂,隆重舉行新堂奉獻典禮。由林家駿主教主禮。新堂為人口稠密的祐漢區展開福傳的工作。
— 新堂奉獻典禮前,又邀請澳督章奇立伉儷等多位嘉賓,進堂參觀。
5月16日 — 澳門天主教修女聯會,舉辦朝聖郊遊聯歡活動。
5月18日 — 九澳青年營舍及培育中心,舉行平頂儀式。
5月23日 — 九八年第廿九屆明愛慈善園遊會,扣除各項開支後,純收益為澳門幣三百萬零二千餘元。
5月25日 — 佛牙舍利迎送團來澳訪問,拜會教區林主教。
6月10日 — 澳門葡國日、賈梅士日及葡僑日,林家駿主教榮獲澳門政府頒授英勇勳章。
6月11日 — 善牧女修會為慶祝「奉獻全世界給耶穌聖心」一百週年,亦為紀念善牧會真福瑪利亞・杜勞斯修女逝世一百週年,隆重舉行感恩聖祭。
6月13日 — 明愛在四旬期發起的濟貧捐款活動,收集善款共七十七萬餘元。
6月21日 — 聖類斯公撤格之家,邁向三十週年慶典,澳督韋奇立將軍應邀參與。
6月27日 — 聖若瑟教區中學舉行師範及中學部畢業典禮,敦請澳門總督韋奇立將軍、教區主教林家駿主禮。
7月4日 — 二千禧年活動籌委會,舉行「澳門青年日」活動。
7月11日 — 明愛安老服務部與婦女中心合辦「九九活力松柏慈善健康行」活動,共籌得善款澳門幣一萬五千餘元。
7月18日 — 兩年制教友神學普及課程畢業感恩祭,由林主教主禮,並頒發畢業證書。
7月21日 — 第二屆東亞區天主教大專會議,澳門大學天主教同學會派代表,前赴台灣參加。
7月23日 — 澳門聾人協會創辦人陳民安神父,榮獲世界聾人聯合會授予一等國際社會功績勳章。
8月7日 — 「亞洲青年日」在泰國舉行,教區組成一個三十人的代表團出席。
8月25日 — 第五屆東亞區教友大會在香港召開,本澳教區派代表團參加。
9月1日 — 慈幼會孔智剛神父出任鮑思高學校校長。
9月3日 — 九九東亞區天主教報業協會,在澳門舉行年會。
9月3日 — 松山燈塔旁之聖母等地殿小堂修葺工程完竣,由林主教主持聖堂祝聖重開感恩祭。
9月4日 — 由聖安多尼堂頤老之家舉行「九九澳門耆老話劇匯演。」
9月26日 — 澳門教區社會傳播中心,熱烈慶祝成立廿五週年。
9月27日 — 每月泰澤祈禱小組舉行祈禱聚會,為台灣大地震死傷者祈禱。收集教友捐獻為澳門幣一萬一千多元。
10月3日 — 聖羅撒女子中學中文部校慶活動,共籌善款澳門幣廿六萬二千餘元。
10月6日 — 澳門教區隆重慶祝前任首牧高秉常主教、莫慶恩神父晉鐸金禧。
10月17日 — 普世博愛運動聯同澳門明愛及葡國童軍總會,為援助台灣及東帝汝兩地災民,發起慈善步行籌款活動,共籌得善款四十七萬多元。
10月24日 — 九九年傳教節教友捐獻為四萬三千四百多元。
11月4日 — 聖若瑟教區中學舉行第廿五屆校運會暨九九校運迎回歸,敦請候任澳門特區行政長官何厚鏵、林主教等為大會主持剪綵。
11月6日 — 澳門明愛舉行第三十屆明愛慈善園遊會,由澳督韋奇立及林主教等多位嘉賓主持揭幕禮。
11月9日 — 聖羅撒英文中學新校舍落成揭幕典禮,敦請澳督韋奇立將軍、教區林家駿主教等嘉賓主持。
11月12日 — 鮑思高青年村隆重舉行落成揭幕祝聖典禮,主禮嘉賓有:澳門林家駿主教、香港陳日君主教、慈幼會省會長何廣凌神父及政府官員等。
11月19日 — 澳門天主教學校聯會舉辦「聖父年慶回歸迎千禧」活動,其中有「天主教救恩史舞蹈匯演」,一千五百多人出席。
11月27 日 — 嚶鳴合唱團假澳門文化中心,舉行嚶嗚妙韻迎千禧演唱會。
12月3日 — 澳門聖若瑟修院聖堂修葺工程完竣,敦請澳督韋奇立主持聖堂重開揭幕禮,並由林家俊主教主持聖堂祝聖禮。
12月3日 — 教宗若望保祿二世向澳門教區發表牧函。
12月5日 — 林家駿主教與釋機修大師等,餞別澳督韋奇立將軍。
12月5日 — 慈幼校友會歡聚一堂,舉行「迎回歸慶千禧回校日」活動。
12月8日 — 耶穌聖心金邦尼傳教會白安哲修士,矢發終身聖願。
12月8日 — 慈幼中學在校慶日,舉行新校舍平頂禮。
12月15日 — 路環竹灣會議中心竣工落成典禮,由澳督韋奇立將軍主持剪綵揭幕體,並由林主教主持祝聖儀式。
12月18日 — 葡國總統沈拜奧與在澳門文化中心,向林主教頒授勳章。
12月19日 — 澳門明愛家庭服務部舉辦「跨世紀・慶回歸・迎聖誕」餐會,招待約一千多人參加。
12月19日 — 澳門教區林家駿主教,應邀出席當晚由中葡兩國政府舉行的澳門政權交接儀式,及各項慶典活動。澳門教區上午在主教座堂,舉行葡語祈福彌撒。葡國總理古特雷斯、澳督韋奇立及多位官員等參與。
12月20日 — 澳門教會在澳門特別行政區成立首日,舉行「慶回歸・迎千禧」祈福彌撒,由林主教偕同近五十位司鐸聯合共祭。澳門特別行政區行政長官何厚鏵先生偕同多位新官員參與慶典。另澳門教區又於當日中午,參與澳門各界慶祝澳門回歸祖國活動委員會主辦之「邁向美好明天」大巡遊活動,派出花車參與巡遊。
12月23及24日 — 二千禧年活動籌委會在23日主辦「結伴同行」聖誕佳音歌劇,地點在市政廳廣場舉行。另在24日下午在主教山聖堂前廣場,舉行全澳教友迎千禧露天祈禱會。此外,二千禧年活動籌委會,又定於2000年1月2日至5日,舉行一個名為「教會路向探索研討會」。
12月24日 — 主教座堂及全澳各聖堂舉行「聖誕子夜及聖年開幕彌撒」。
澳門主教公署。澳門教區成立四百三十週年教聞摘錄 (1576-2006)。澳門:教區事務統籌秘書處,2006。

